RNA测序新发现：一种食品添加剂与癌症生长有关联

延胡索酸，又称富马酸，它的味道像水果，该品可作为一种食品添加剂——酸味剂，用于清凉饮料、水果糖、果冻、冰淇淋等，大多与酸味剂柠檬酸并用，同时在食品中还用于肉制品、鱼肉制品加工等。在三羧酸循环期间，它通常作为一种中间产物，被细胞用来产生能量。就是这个生活中很常见的食品添加剂，看似很普通无害，却让最新发表在Nature上的研究找到了它另一个真面目。

来自英国剑桥大学医学研究委员会（MRC）等机构的研究人员证实当代谢物延胡索酸在一种遗传性肾癌中积累时，它导致一种促进癌症生长的表观遗传重编程。他们观察到的这种肿瘤生长机制与肺癌和肠道等其他癌症相似。相同点是：在这些癌症中，降解延胡索酸的酶不存在或者功能不齐全。

延胡索酸累积抑制microRNA(microRNA的作用是防止肿瘤恶化

遗传性平滑肌瘤病肾细胞癌（HLRC）是一种罕见的癌症，导致皮肤瘤，并且能够导致肾癌。已知这种疾病与编码延胡索酸水合酶（FH）的基因发生的一种突变相关联，但是在此之前，人们仍不清楚这如何导致肿瘤生长。FH是在线粒体中发现的。

在这项新的研究中，研究人员将RNA测序与代谢组学结合在一起，发现了导致肿瘤生长的真正过程。

研究人员发现由于FH缺失所产生的过量的延胡索酸导致一种被称作miR-200的微RNA（microRNA）发生表观遗传变化。这导致miR-200受到抑制，其中miR-200发挥着阻止癌细胞转移的功能。失去了miR-200的保护功能，这些表观变化导致启动上皮-间质转化（EMT）的基因表达。而这正是正常的细胞发生癌变和转移而在全身扩散的过程。

RNA测序分析数据如下图：

延胡索酸参与其他癌症的过程尚未清楚

如今在知道与FH缺失相关的肿瘤生长机制的基础上，未来的研究将着重关注延胡索酸如何参与其他癌症。比如，像同样是FH缺失的癌症，包括非遗传性肾癌、神经母细胞瘤和肾上腺瘤。鉴于癌细胞转移是癌症病人死亡的主要病因，理解如何阻断延胡索酸导致的癌细胞转移可能是开发癌症疗法的一种关键策略。未来也需要开展的研究是进一步理解延胡索酸在正常条件下的作用。

论文通信作者Christian Frezza博士说，“我们的研究发现提示着破坏FH和由此导致的延胡索酸积累在这种类型的肾癌中发挥着关键作用。这可能也是其他肿瘤类型（已报道也发生FH缺失）的一个特征。”

MRC分子与细胞医学主任Nathan Richardson博士（未参与这项研究）说，“这项研究的结果让我们更加清楚地认识延胡索酸如何参与这种类型的肾癌。它如今让我们有机会观察这是否也适用于其他常见的癌症类型，以及代谢过程与这种疾病的发展之间的关系。”

参考文献：

《Fumarate is an epigenetic modifier that elicits epithelial-to-mesenchymal transition》

诺赛基因 Small RNA 测序：

技术简介：Small RNA是是一类长度在20～30nt的非编码RNA，主要包括微小RNA（miRNA）、小干扰RNA（siRNA）和与piwi相互作用piRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的数百万条Small RNA序列信息，依托强大的生物信息分析平台，鉴定已知小RNA，并预测新的小RNA及其靶标基因。 

送样要求：

样本类型：完整且无污染的总RNA；

样本需求量：≥10 μg；

样本浓度：≥200 ng/μL；

样本纯度：OD260/280 =1.8~2.2；OD260/230≥2.0；

28S:18S≥1.5；RIN≥8.0；

23S:16S≥1.5 （此项要求只针对原核生物）。

技术优势：

l 不依赖已知信息：可对任意物种、任意大小、已知或未知的小RNA进行序列测定，可以鉴定已知miRNA，也可预测新的miRNA。

l 分辨率高：可检测单个碱基差异，区分相同家族或序列相似性极高的小RNA。

l 通量高：可精确检测出几个到数十万个拷贝的小RNA。